武定县疾病预防控制中心于2003年3月14日在原武定县卫生防疫站的基础上组建成立。其历史沿革：1951年7月成立武定专署卫生防疫大队,1953年8月改为武定县中心卫生院防疫组,1962年10月更名为武定县卫生防疫站,1985年8月合并组建武定县卫生防疫妇幼保健站,1995年3月单设为武定县卫生防疫站，2003年3月在武定县卫生防疫站的基础上组建为武定县疾病预防控制中心。

中心现有业务用房5010m2，其中实验室面积2210m2；实验室通过省级认证试验项目169项,拥有仪器设备145台(件)。

中心现有在职职工45人，其中:本科学历35人，专科学历10人。有卫生专业技术人员42人，其中:高职9人、中职12人、初职21人。中心设党支部一个，共有党员23人。